PltA

Enzyme Information
reference: 10.1016/j.jsb.2015.09.013
host: Escherichia coli BL21 (DE3)
test: Crystallization
producer: Pseudomonas fluorescens Pf-5
phmm-model: FDH_pyrrole.hmm

Gene Data
phmm effect mutation gene_name reference
130 dimeric interface V141 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
291 FAD binding; isoalloxazine ring Tyr299 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
35 None Glu35 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
- hairpin between beta-bet1 strands and helix alpha1; FAD binding GxGxxG PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
270 chloride binding; NOT conserved in other FDHs due to lack of bound chloride at analogous site Glu278 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
271 chloride binding; NOT conserved in other FDHs due to lack of bound chloride at analogous site N279 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
269 chloride binding; NOT conserved in other FDHs due to lack of bound chloride at analogous site R277 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
363 chloride binding; conserved in FDHs W371 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
321 FAD binding; oxyanion hole like environment Val329 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
288 chlorination mechanism; conserved in Trp-halogenases, but not in homologs; homologs have F326 in this position; FAD binding; isoalloxazine ring Glu296 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
230 FAD binding; isoalloxazine ring Trp239 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
194 FAD binding; isoalloxazine ring Ala203 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
318 FAD binding; isoalloxazine ring Ser326 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
315 FAD binding; isoalloxazine ring; chloride binding Pro323 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
312 FAD binding; isoalloxazine ring; chloride binding F320 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
44 FAD binding; isoalloxazine ring Val44 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
45 FAD binding; isoalloxazine ring Gly45 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
135 dimeric interface E146 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
160 nonpolar interactions between two symmetric patches of hydrophobic surface Ile171 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
158 nonpolar interactions between two symmetric patches of hydrophobic surface Val169 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
153 nonpolar interactions between two symmetric patches of hydrophobic surface Leu164 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
134 nonpolar interactions between two symmetric patches of hydrophobic surface Val145 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
131 nonpolar interactions between two symmetric patches of hydrophobic surface Phe142 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
121 H-bond with Glu40 main chain NH Glu132 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
26 H-bond with Glu132 side chain carboxyl group Glu40 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
156 nonpolar interactions between two symmetric patches of hydrophobic surface Arg167 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
- polar-charged residue contact with Arg167 Asp5 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
30 F39 side chain orientation; holding the diphosphate group; conserved in non-Trp halogenases; in a loop conserved in CmlS, CndH and 3NIX R41 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
32 holding the diphosphate group; conserved in non-Trp halogenases; in a loop conserved in CmlS, CndH and 3NIX H43 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
28 FAD binding F39 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
29 F39 side chain orientation Glu40 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
329 Predicted to interact with the phospho group of the substrate R337 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
337 chlorination mechanism; conserved in Trp-halogenases, but not in homologs; homologs have F326 in this position Glu345 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
62 conserved in FDHS; HOCl diffuses to this residue; Lys73 in PltA, Lys79 in PrnA and RebH, Lys71 in CmlS, Lys76 in CndH Lys73 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
112 holding the diphosphate group; conserved in non-Trp halogenases R123 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
117 polar-charged residue contact with Glu140 Arg128 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3
132 main chain carbonyl oxygen is hydrogen bonded to the main chain nitrogen of the same residue of the other monomer and vica versa Gln143 PltA DOI: h DOI: t DOI: t DOI: p DOI: : DOI: / DOI: / DOI: 1 DOI: 0 DOI: . DOI: 1 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 6 DOI: / DOI: j DOI: . DOI: j DOI: s DOI: b DOI: . DOI: 2 DOI: 0 DOI: 1 DOI: 5 DOI: . DOI: 0 DOI: 9 DOI: . DOI: 0 DOI: 1 DOI: 3